青浦历史悠久。7000年前已经成陆，6000年前已有先民居住，他们在这块土地上劳动生息繁衍，创造了灿烂的古代文化。"崧泽文化"是太湖地区新石器时代具有一定典型性代表的原始社会文化，由此断定青浦地区是上海迄今为止发现的人类最早的聚居地。

明嘉靖二十一年（1542年），建制青浦县。1999年9月16日，经国务院批准，撤销青浦县建制，建立青浦区，以原青浦县的行政区域为青浦区的行政区域。2000年1月12日，青浦区人民政府机构正式挂牌。